诊断学理论与实践

诊断学理论与实践 ›› 2008, Vol. 7 ›› Issue (05): 511-516.doi: 10.16150/j.1671-2870.a2154

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近全长序列分析HIV-1独特型CRF01_AE/B'重组病毒基因

杨洋, 周磊明, 薛以乐, 潘启超, 康来仪, 戚中田, 钟平,   

  1. 第二军医大学微生物教研室上海市医学生物防护重点实验室;上海市疾病预防控制中心艾滋病性病科上海市艾滋病研究中心;
  • 出版日期:2008-10-25 发布日期:2008-10-25

  • Online:2008-10-25 Published:2008-10-25

摘要： 目的:对上海市发现的1例独特类型的CRF01_AE/B'重组病毒株进行近全长序列分析,以了解其DNA序列的特征。方法:应用巢式逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法,分段扩增HIV-1近全长基因组相应片段,进行克隆、测序,并分析其遗传进化树和序列断点位置。结果:近全长序列分析提示,该患者所感染的病毒由CRFO1_AE和HIV-1B'亚型嵌合组成,两者各占约50%。其多聚酶蛋白基因(Pol)和外膜糖蛋白基因(Env)区均有HIV-1B'亚型片段和CRFO1_AE片段嵌合组成。2种亚型病毒DNA片段嵌合点的位置与过去报道的重组病毒株(CRF15_AE/B、CRF33_AE/B和CRF34_AE/B)均不同。结论:在我国常见流行的HIV-1 CRF01_AE重组病毒与B'亚型已在HIV-1感染人群中发生重组,其可能是在我国散发流行的独特型重组病毒株。

关键词: 人免疫缺陷病毒Ⅰ型, 基因亚型, 重组, 近全长序列分析

Key words: Human immunodeficiency virusⅠ, Gene subtype, Recombinant, Near full-length sequence analysis