组织工程与重建外科杂志 ›› 2012, Vol. 8 ›› Issue (3): 140-145.doi: 10.3969/j.issn.1673-0364.2012.03.005

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颅缝早闭症相关实验荧光定量PCR内参基因的选择研究

杨娴娴,JODIE T HATFIELD,SUSAN J HINZE,穆雄铮,PETER J ANDERSON,BARRY C POWELL   

  1. 上海交通大学医学院附属第九人民医院整复外科;澳大利亚颅颌面外科中心;阿德莱德妇女儿童健康研究中心;复旦大学医学院附属华山医院整形外科
  • 发布日期:2020-07-23

Reference Gene Selection for RT-qPCR Gene Expression in Researches of Craniosynostosis

YANG Xianxian1,Jodie T Hatfield2,Susan J Hinze2,MU Xiongzheng3,Peter J Anderson2,Barry C Powell2   

  1. 1 Department of Plastic and Reconstructive Surgery,Shanghai Ninth People’s Hospital,Shanghai Jiaotong University School of Medicine,Shanghai 200011,China;2 Australian Craniofacial Unit,Women’s and Children’s Hospital,Women’s and Children’s Health Research Institute,Adelaide 5006,Australia;3 Department of Plastic and Reconstructive Surgery,Huashan Hospital,Fudan University School of Medicine,Shanghai 200040,China.
  • Published:2020-07-23
  • Contact: 国家自然科学基金  (81171835);上海市科委非政府间国际合作项目  (10410701300)

摘要: 目的探讨用于颅缝早闭症相关实验的荧光定量PCR的最佳内参基因。方法应用与颅骨成骨、颅缝闭合相关的3组实验标本,分别为:Fgfr2cC342Y/+Crouzon综合征小鼠颅缝组织、颅缝早闭患者体外培养颅缝原代细胞和体外培养的小鼠Kusa 4b 10成骨细胞株。以常用的候选管家基因作为研究对象,利用geNorm软件对RT-qPCR结果进行比较分析,以筛选出在不同组织细胞中表达最为稳定的管家基因作为内参。结果Fgfr2cC342Y/+小鼠颅缝组织,Cyc1-Gapdh-Canx为最佳组合;颅缝早闭症患者体外培养颅缝原代细胞,18S rRNA和ATP5B为最佳组合;体外培养的小鼠Kusa 4b10成骨细胞株,18S rRNA和Canx为最佳组合。选择不同内参基因对目的基因RT-qPCR的结果影响显著。结论在设计RT-qPCR实验之前,应针对所选择的标本类型与种类进行管家基因稳定性分析,以增加结果的可信度。

关键词: 颅缝早闭症, 荧光定量聚合酶链反应, geNorm分析

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