内科理论与实践 ›› 2023, Vol. 18 ›› Issue (04): 266-269.doi: 10.16138/j.1673-6087.2023.04.011
收稿日期:
2023-06-05
出版日期:
2023-08-30
发布日期:
2024-01-09
通讯作者:
叶 蕾 E-mail: 基金资助:
LI Haorong, HAN Rulai, YU Danyan, YE Lei()
Received:
2023-06-05
Online:
2023-08-30
Published:
2024-01-09
摘要:
目的:建立用于甲状腺结节分子分型的二代靶向测序方案。方法:基于生物素化探针靶向捕获和高通量测序技术,对112个甲状腺结节相关基因进行靶向测序,建立用于甲状腺结节分子分型与分化水平的二代靶向测序方案,甲状腺结节Panel(ThyNod Panel,甲结Panel)。基因包括甲状腺良性结节相关基因、甲状腺恶性肿瘤相关基因、甲状腺发育和功能基因、细胞来源标志基因等,检测目的基因碱基替换、插入缺失、拷贝数变异和融合等突变类型以及基因表达水平。使用甲结Panel对良恶性甲状腺结节进行分子分型。结果:成功构建并应用甲结Panel,完成856例良恶性甲状腺结节检测。其中676例甲状腺结节检出意义明确的突变,占比79.0%。627例甲状腺结节病理诊断明确,良性结节占比17.6%。甲状腺恶性肿瘤病理类型包括经典性乳头状癌、滤泡亚型乳头状癌、髓样癌等。最常见的突变检出基因为BRAF(n=426),其次是RET(n=68),RET/PTC融合(n=68),DICER1(n=35),还有端粒酶逆转录酶(telomerase reverse transcriptase, TERT)(n=35)、HRAS(n=24)、NRAS(n=23)、神经营养酪氨酸受体激酶(neurotrophin receptor kinase, NTRK3)融合基因(n=19)、真核翻译起始因子1A,X染色体(eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal, EIF1AX)基因(n=11)等。对检出突变统计结节恶性率,BRAF V600E、RET融合变异等结节恶性比例高于90.0%,而RAS-类变异恶性率仅为18.9%。结论:甲结Panel可有效进行甲状腺结节的分子分型。
中图分类号:
李浩榕, 韩如来, 郁丹燕, 叶蕾. 甲状腺结节良恶性的分子分型研究[J]. 内科理论与实践, 2023, 18(04): 266-269.
LI Haorong, HAN Rulai, YU Danyan, YE Lei. Molecular study of benign and malignant thyroid nodules[J]. Journal of Internal Medicine Concepts & Practice, 2023, 18(04): 266-269.
表1
甲结Panel检出突变的恶性百分比[n(%)]
基因 | 恶性 | 良性 | 总计 |
---|---|---|---|
BRAF V600E | 336(98.0) | 7(2.0) | 343 |
RET融合 | 27(90.0) | 3(10.0) | 30 |
TERT | 26(100.0) | 0(0.0) | 26 |
NRAS/HRAS/KRAS | 8(29.6) | 18(66.7) | 27 |
NTRK3融合 | 14(93.3) | 1(6.7) | 15 |
DICER1 | 1(10.0) | 9(90.0) | 10 |
BRAF融合 | 8(88.9) | 1(11.1) | 9 |
EIF1AX | 1(11.1) | 8(88.9) | 9 |
IGF2BP3融合 | 0(0.0) | 7(100.0) | 7 |
CHEK2 | 4(66.7) | 2(33.3) | 6 |
ALK融合 | 4(100.0) | 0(0.0) | 4 |
TP53 | 3(100.0) | 0(0.0) | 3 |
PIK3CA | 3(100.0) | 0(0.0) | 3 |
ATM | 3(100.0) | 0(0.0) | 3 |
EZH1 | 0(0.0) | 4(100.0) | 4 |
SPOP | 0(0.0) | 4(100.0) | 4 |
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